Po podpisu mnichovské dohody se odstěhoval do Kroměříže, kde působil jako ředitel kněžského svépomocného hospodářského sdružení Unitas. V říjnu roku 1941 byl zatčen, převezen do Brna a koncem ledna 1942 byl převezen do koncentračního tábora Osvětim, kde 9. února 1942 zahynul.

Jaktařští farníci však na Aloise Šebelu a jeho desetileté působení v jejich farnosti nezapomněli a pamětní deska, jejímž autorem je opavský sochař Daniel Klose, bude odhalena u příležitostí výročí osmdesáti let jeho mučednické smrti v osvětimském koncentračním táboře.

Farnost sv. Petra a Pavla si bude památku otce Šebely připomínat poutní slavností celý víkend. V sobotu 25. června bude slavnostnímu odhalení pamětní desky předcházet mezifarní fotbalový zápas na orelském hřišti. V neděli zahájí v místním kostele oslavy v 9.30 hodin mše svatáa po ní dojde k odhalení pamětní desky. Ve 14.30 hodin bude oslava pokračovat pobožností a farním dnem na zahradě.